《名侦探柯南：红之校外旅行 鲜红篇&恋红篇》为柯南系列特别篇，为《名侦探柯南》第290个案件。故事讲述柯南在暂时恢复为工藤新一时，恰巧为帝丹高中校外旅行时期，一行人前往京都参访，在清水寺认识了女演员鞍知景子，新一被请托解读暗号，却在过程中遇上杀人事件，犯罪现场更留下疑似天狗袭击的痕迹。在一连串的骚动中，新一能否解开暗号，让真相拨云见日？...

知名舞台剧女演员牧树里这日收到怪盗基德的预告信：在26个字母的盘旋飞舞中，他来拜领无价的“命运的宝石”。毛利小五郎受到牧树里委托将信件分析，认为基德将在演出最后一晚前来盗取宝石，当晚他及柯南、小兰等人来到剧场，那里早有诸多警察守候。令柯南吃惊的是，基德竟扮成工藤新一出现在众人面前，但他及众人方向不同的紧张过后，宝石并没被盗，柯南醒悟字母预告信与航班相关。而柯南、小兰、牧树里及其同事搭乘的前往北海道...